Воздухозаборник самолета - регулируемый. Площадь входного сечения изменяется при помощи вертикально расположенных створок клиньев. Входные части воздухозаборника отстоят от боковой поверхности фюзеляжа, образуя щели для слива пограничного слоя, который затем с помощью профилированных перегородок направляется на верхнюю и нижнюю поверхность фюзеляжа. Управление клиньями воздухозаборника осуществляется системой УВД-23. Топливная система включает четыре фюзеляжных и шесть крыльевых баков-отсеков, а также два отсека, обеспечивающих питание двигателя топливом при отрицательных перегрузках. Крыльевые ПТБ емкостью 480 л устанавливаются и сбрасываются совместно с держателем (сброс производится при помощи пиротолкателя). Их эксплуатация возможна только при крыле, установленном на угол 16 град.

Общесамолетные системы. Гидросистема подразделяется на две автономные системы: бустерную и общую. Каждая из них имеет насос переменной производительности НП-70А-3, приводимый в действие от самолетного двигателя. Рабочее давление в гидросистеме 210 кг/кв.см. Воздушная система состоит из двух подсистем: основной и аварийной. Система управления включает в себя системы продольного, поперечного и путевого управления, а также систему управления стреловидностью крыла. Кроме того, самолет оснащен системой САУ-23АМ, обеспечивающей автоматическое управление самолетом по трем каналам. Верхняя часть РУС представляет собой рукоятку, связанную с трубкой ручки при помощи карданного устройства, обеспечивающего возможность "перелома" РУС в продольном и поперечном направлениях. "Перелом" необходим для включения сдублированных концевых микровыключателей, обеспечивающих выключение автопилота САУ (происходит как бы "пересиливание" ручки летчиком и быстрый выход на ручной режим управления без каких-либо дополнительных специальных действий выключателями).

САУ-23АМ - трехканальная система, осуществляющая автоматическое управление самолетом по трем осям. Исполнительные механизмы САУ - рулевые агрегаты РАУ-107А, включенные в каждый из каналов управления. Электромеханическая система ограничения углов атаки (СОУА) предназначенная для обеспечения возможности полного использования маневренных характеристик самолета МиГ-23, исключая при этом выход его на режим сваливания в следствии чрезмерного отклонения РУС "на себя". Это обеспечивается автоматическим отводом ручки "от себя" в случае достижения максимально допустимого (для данного угла стреловидности крыла) угла атаки с учетом скорости его нарастания. Исходными параметрами служат текущие значения углов атаки, поступающие от датчиков углов атаки.

Целевое оборудование. В состав БРЭО входит импульсно-доплеровская РЛС С-23 "Сапфир-23" (МиГ-23П), параболическая антенна, которая имеет сектор обзора в горизонтальной плоскости +/-30 град и вертикальной 6 град. Возможно обнаружение и сопровождения целей, летящих на фоне земли, а также одновременное сопровождение до четырех целей "на проходе" (однако одновременный пуск УР возможен лишь по одной цели). Максимальная дальность обнаружения целей с ЭПР 16 кв.м. - 70 км, максимальная дальность автоматического сопровождения - 55 км. Теплопеленгатор ТП-23М способен обнаруживать и сопровождать воздушные цели в пассивном режиме с условиях радиопомех. Система "Лазурь" обеспечивает наведение истребителя в директорном режиме по командам наземной АСУ с высокой степенью помехозащищенности. На ИЛС АСП-17МЛ выводится вся необходимая пилотажная и прицельная информация (обычный радислокационный индикатор в кабине истребителя отсутствует). Самолет оснащен радиостанцией Р-832М, аварийной радиостанцией Р-855УМ, автоматическим радиокомпасом АРК-10 или АРК-15М, маркерным радиоприемником МРП-56П, радиовысотомером РВ-4, самолетной аппаратурой радиотехнической системы ближней навигации РСБН-6С, ответчиком СО-69, системой предупреждения и оповещения СЗМ, системой постановки активных радиолокационных помех "Репер"Н.